黑水虻养殖所面临的问题主要包括：

1.土地规划问题：建议土地规划管理部门支持黑水虻养殖的生产用地，将其用地纳入规划管理，进行统一安排。

2.产业链不完善：黑水虻的养殖需要土地支持，其用地条件为一般农村集体建设用地且不要求比较好的区位条件，不会占用过多的土地，更不会占用农用地。因此，建议实施工厂化养殖，达到集约节约用地，提高投入产出密度。

3.技术标准缺失：国内没有统一的技术参数标准，企业养殖缺乏统一的依据，导致行业内技术规范较为混乱，制约了该产业的发展。

4.研发投入不足：黑水虻养殖企业虽然已经基本具备了扩大养殖规模、实现产业化的部分条件，但是由于环保要求越来越高，实施封闭式生产，达到零污染仍需要加大研发和投入。

5.融资压力大：因为黑水虻产业发展处于初级阶段，很多企业仍处于亏损状态，形成规模优势需要时间和条件支持，缺乏对资金的吸引力，融资压力大。

6.政策支持不足：因为是新兴事物，能享受的有效直接支持的政策很少，这成为黑水虻养殖产业健康快速发展的很大阻力。

7.缺乏全产业链发展意识：可以关注这一集生态农业、绿色工业与环境保护高度融合的新业态，积极引导、凝智聚力、协调各方利益，将这一新业态维护好、支持好、发展好。

黑水虻养殖是一个新兴产业，需要政府、企业和社会各方面的共同努力来推动其健康快速发展。